招收宗旨：
本系僅收正式生

入學資格：
一、一年級正式生 ：
　１.大學哲學系（組）畢業，獲有哲學學士或以上學位，並有成績單證明曾修士林哲學所有主要論題（至少20學分），由本院審查認可者。
　 ２.大學其他系（組）畢業，獲有學士或以上學位（或三專畢業持有畢業證書），並有成績單證明曾修習有關哲學課程至少44學分（應包括士林哲學所有主要論題及中西哲學史），由本院審查認可者。
　 ３.修畢天主教大修院哲學課程，成績及格，持有成績證明者。
　 ４.二專或五專畢業持有畢業證書，並有成績單證明畢業後曾正式修習二年以上的人文及哲學科目，其中哲學科目至少44學分，由本院審查認可者。
　 ５.高中（高職）畢業（或具同等學力）持有證明文件，並有成績證明曾修習二年以上的人文及哲學科目（至少64學分，見下），由本院審查認可者。
　 ６.人文學科應包括：國文6學分，英文6學分，理則學2-4學分。哲學科目應包括：士林哲學所有主要論題20學分，中國哲學史8學分，西洋哲學史8 學分。

二、轉學生：
　　曾在其他天主教神學院神學系（頒S.T.B.或M. Div.）學位者肄業，持有成績證明修業一年以上，並修畢與本院相當課程30學分以上者。

三、非華語區學生：
　　所有來自非華語地區的學生，必須曾在使用中國語文為主的地區修習中文及國語，至少五個學期（或有相當的程度），方接受入學。

修業年限及所頒學位
一、正式生修業三年，可增加第四年（理論實習並重的牧靈神學年），轉學生入學後必須以正式生身份連續修業兩年以上，方可參加神學畢業總考。神學畢業總考學生應在四個月前提出應考的申請。

二、本系學生完成前三年修業年限，修畢所有必修課程，且具有下列學分要求者，方可參加信理神學畢業總考：
　１.人文及哲學科目：至少64學分。
　２.神學科目：至少105學分（入學前曾修習的神學科目，若是在畢業年度前十年內獲得，可被承認合併計算，但課程性質及內容相同的學分不得重複計算）。
　３.至少曾選四次合作研究課程，並撰寫四篇相關的學期論文。
　４.上述（１）、（２）兩項，合計至少170學分。

三、學位頒授
　１.畢業總成績計算方式如下：前三年各年度平均成績及神學畢業總考成績各佔25%。
　２.入學時已得有學士或以上學位的本系學生，神學畢業總考及畢業總成績均達七十分或以上者，頒「神學士」（S.T.B.）及「道學碩士」（M. Div.）雙重學位。
　３.本系學生，神學畢業總考及畢業總成績均及格者，頒「神學士」（S.T.B.）學位。
　　（１）神學畢業總考三位考試委員中，若有兩位給分達六十或以上，而三位給分平均未超過六十分者，總考成績以六十計算。
　　（２）神學畢業總考三位考試委員中，若有兩位給分未達六十分者，應於下次舉行神學畢業總考時補考，補考以一次為限，補考及格者，成績一律以六十分計算。
　４.本系學生神學畢業總考不及格雖經補考仍不及格者，頒「神學系結業證者」。

一、輔大神學院神學系學生，若有宗教學研究所報考資格，可於一年級下學期參加宗研所入學考試。錄取後，可同時修讀教廷承認的「天主教神學士」及中華民國教育部承認的「宗教學碩士」（M. A.）雙學位。

二、神學系學生考上宗教學研究所，一律加入其「基督宗教組」。

三、除部分宗教學研究所必修、但無法以神學系既有學分相抵的少數課程，算作神學系的合作研究及其學期論文外，其餘均以神學系現有學分擇優計入宗教學研究所學分。

四、前三年應先修完神學系的105分，並在適當時間參加神學畢業總考，取得天主教神學士學位。

五、第四年（法定牧靈神學年）中，一方面選修一些牧靈神學的課，一方面寫宗研所的畢業論
　　 文，通過論文考試，取得宗教學碩士學位。